背景介紹

　　如拳頭一般大小的心臟，在生命體還是一枚胚胎時(shí)就開始了它的第一次“跳動(dòng)”，此后在人的一生中不辭辛勞地推動(dòng)血液流動(dòng)，輸送氧氣和各種營(yíng)養(yǎng)成分，維持著人體各個(gè)器官和細(xì)胞的運(yùn)作。而如今，心血管疾病已成為一種嚴(yán)重威脅人類健康的常見病。目前，中國(guó)心血管病患病率仍處于持續(xù)上升階段，據(jù)推算心血管病患病人數(shù)已達(dá)3.3億人。因此關(guān)于心血管疾病的致病基因及其遺傳變異功能的研究也愈發(fā)重要。

　　目前研究此類疾病致病機(jī)理的手段之一是以昆蟲為模式生物，果蠅、飛蝗等昆蟲在心臟發(fā)育過(guò)程中具有與人類相似的基因調(diào)控機(jī)制，且具有發(fā)育周期短、可塑性強(qiáng)等特性，已成為研究心臟功能及心臟疾病致病基因的有力工具。光學(xué)相干層析技術(shù)技術(shù)(OCT)因具有無(wú)創(chuàng)、實(shí)時(shí)、高分辨率等特點(diǎn)，已成功應(yīng)用于昆蟲等小型模式生物的心臟功能檢測(cè)方面。但目前關(guān)于心臟功能參數(shù)測(cè)量(如心率等)的計(jì)算方法仍存在效率低、對(duì)圖像質(zhì)量要求高、參數(shù)測(cè)量不準(zhǔn)確等問題，尤其不適用于生物實(shí)驗(yàn)中大樣本量的檢測(cè)分析。

　　因此，研究更高效率的自動(dòng)檢測(cè)算法以適應(yīng)高通量的模式生物致病基因篩查及其表型分析，成為目前亟需解決的問題之一。

　　創(chuàng)新研究

　　河北大學(xué)光信息技術(shù)創(chuàng)新中心蘇亞副教授團(tuán)隊(duì)在之前關(guān)于昆蟲胚胎發(fā)育及其基因表達(dá)調(diào)控的表型測(cè)定的工作基礎(chǔ)上，以飛蝗為模式生物，提出了一種新的自動(dòng)快速定量計(jì)算昆蟲心臟功能參數(shù)的方法，能夠?qū)π呐K舒張末期直徑(EDD)、收縮末期直徑(ESD)、舒張末期面積(EDA)、收縮末期面積(ESA)及心率(HR)等心臟功能參數(shù)進(jìn)行準(zhǔn)確的定量測(cè)量，該方法尤其適用大樣本量(通常數(shù)量≥30)的生物體檢測(cè)。所提方法是在OCT成像特點(diǎn)基礎(chǔ)上得到的M-Mode圖來(lái)進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。M-Mode圖像常用于超聲心動(dòng)圖中，用于評(píng)估心臟動(dòng)力學(xué)，如收縮同步性、心肌工作、心室內(nèi)血流動(dòng)力學(xué)等。

　　昆蟲心臟功能參數(shù)定量檢測(cè)計(jì)算方法如圖1所示。研究團(tuán)隊(duì)將采集得到的720個(gè)B-scan每幅圖像里胚胎心臟腔室中心的A-scan取出，位置如圖2(b)中藍(lán)色虛線所示，按采集時(shí)間順序排列即得到M-Mode圖。如圖3(a)所示，M-Mode圖的橫坐標(biāo)為掃描時(shí)間，縱坐標(biāo)為心臟腔室中心位置的A-scan。通過(guò)對(duì)M-Mode圖進(jìn)行灰度變換，再進(jìn)行閾值選取、區(qū)域生長(zhǎng)、邊界識(shí)別和特征峰提取等一系列操作后，即可計(jì)算得出心率(HR)、舒張末期直徑(EDD)及收縮末期直徑(ESD)等參數(shù)。

　　圖1 心臟功能參數(shù)定量檢測(cè)算法流程圖

　　圖2 飛蝗胚胎OCT掃描圖像。(a) 胚胎三維投影圖。紅色虛線框表示胚胎的背血管所在的位置，紅色箭頭表示掃描檢測(cè)位置;(b)和(c)分別為胚胎心臟的舒張末期和收縮末期的二維B-scan截面圖

　　通過(guò)對(duì)原始的M-Mode圖[圖3(a)，雙向箭頭所指位置表示心臟最大舒張直徑和最小收縮直徑]進(jìn)行灰度變換處理，可以得到去除低頻噪聲的M-Mode圖[圖3(b)]，然后選取胚胎心臟腔內(nèi)的任意一點(diǎn)[圖3(c)中的紅色圓點(diǎn)]作為初始的種子點(diǎn)，圖3(d)是在規(guī)定的區(qū)域生長(zhǎng)準(zhǔn)則下得到的二值化的區(qū)域生長(zhǎng)結(jié)果。可以看到，由于灰度分布不均勻?qū)е逻吘壧幊霈F(xiàn)毛刺，這會(huì)對(duì)下一步獲得心臟搏動(dòng)振幅的準(zhǔn)確性產(chǎn)生不利影響。為解決這一問題，研究團(tuán)隊(duì)引入了形態(tài)學(xué)處理，對(duì)腔體邊緣進(jìn)行平滑處理，如圖3(e)所示。此時(shí)，將每一列A-scan邏輯值為0的像素點(diǎn)總數(shù)乘以其長(zhǎng)度，即可得到對(duì)應(yīng)的振幅圖，如圖3(f)所示。如圖3(g)所示，利用峰值提取算法找到極值點(diǎn)后，可計(jì)算HR、EDD和ESD等心臟參數(shù)指標(biāo)。

　　圖3 飛蝗胚胎發(fā)育到第9天時(shí)的OCT M-Mode圖像。(a)未經(jīng)處理的原始圖;(b)經(jīng)過(guò)灰度變換后的M-Mode圖;(c)加入種子點(diǎn)的灰度變換M-Mode圖;(d)閾值分割處理后的M-Mode圖;(e)經(jīng)過(guò)形態(tài)學(xué)處理后的M-Mode圖;(f)蝗蟲胚胎心臟的振幅圖;(g)由振幅圖利用峰值提取找到極值點(diǎn)

　　總結(jié)

　　課題組選取蝗蟲作為評(píng)估心臟功能的模式生物，提出了基于OCT的新的自動(dòng)快速定量計(jì)算昆蟲心臟功能參數(shù)的方法，有效解決了傳統(tǒng)檢測(cè)算法中效率低、對(duì)圖像質(zhì)量要求高、參數(shù)測(cè)量不準(zhǔn)確等問題，該方法在以昆蟲為模式生物的心血管疾病研究方面具有重要的參考價(jià)值。后續(xù)在優(yōu)化算法結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上，利用RNAi技術(shù)抑制模式生物特定基因表達(dá)，結(jié)合本文提出的表型檢測(cè)和心臟功能參數(shù)評(píng)估等技術(shù)手段，深入研究心血管疾病的不同致病基因的表現(xiàn)及作用。

參考文獻(xiàn)： 中國(guó)光學(xué)期刊網(wǎng)

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